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Proteômica
A proteômica estuda a distribuição, a abundância, as modificações, as interações e as funções de uma ou de um grupo de proteínas, ou do conjunto de proteínas em uma célula ou organismo.Para a maioria das técnicas proteômicas aplicadas, é necessária a digestão das proteínas e análise de seus peptídeos, tendo sua identificação realizada através do uso de espectrometria de massas onde a medição precisa da massa e da carga, seguida de comparação computacional dos resultados com bancos de dados, muitas vezes permite identificar de qual proteína foram derivados.
Para amostras biológicas complexas com misturas de muitas proteínas, é necessária a combinação de dois ou mais métodos ortogonais de separação para aumentar a capacidade de separação dos fragmentos e, com isso, um maior poder de resolução, como LC-MS/MS. Nos últimos anos, vários métodos cromatográficos multidimensionais podem ser utilizados em estudos proteômicos shotgun, como cromatografia hidrofóbica ou troca iônica e gel filtração de alta resolução
A Plataforma Proteômica disponibiliza os seguintes serviços:
- Purificação e preparo de amostra;
- Focalização isoelétrica
- Eletroforese e análise 2D de proteínas;
- Excisão de spots/bandas de gel
- Digestão de proteínas
- Concentração e secagem de amostras;
- Análise por espectrometria de massas para identificação.
Espectrometria de Massas
A espectrometria de massas é uma técnica analítica valiosa para identificação, caracterização e quantificação de analitos. Nessa técnica, as moléculas em uma amostra são convertidas em íons em fase gasosa, que são separados no espectrômetro de massas de acordo com sua razão massa sobre a carga (m/z). Os íons produzidos são característicos de um determinado analito e, portanto, é possível sua identificação a partir do espectro de massa gerado.
A proteômica baseada na espectrometria de massa depende da dissociação/fragmentação de peptídeos e/ou proteínas para fornecer informações sobre suas sequências e estruturas. Diferentes tipos de espectrômetros de massa são compatíveis para determinados tipos de análise, como pode ver na descrição dos nossos espaços tecnológicos, e os espectrômetros de massas híbridos com diferentes analisadores acoplados podem ampliar a sua utilidade.
A identificação computacional de proteínas é feita com o auxílio de bancos de dados ou através da busca de similaridades entre espectros, utilizando softwares de busca que comparam a razão m/z teórica e experimental dos peptídeos analisados.
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outras plataformas
Serviços prestados
RPT02I - Caracterização de Proteínas Pernambuco - Recife
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P02-025A :
Purificação de proteínas por cromatografia.
Pernambuco - IAM
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P02-025B :
Purificação de proteínas por cromatografia. Usuário autônomo (requer treinamento).
Pernambuco - IAM
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P02-025C :
Treinamento de usuários em métodos de purificação de proteínas (cromatografia).
Pernambuco - IAM
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P02-025D :
Consultoria para planejamento processo de produção de proteínas recombinantes de interesse científico e biotecnológico
Pernambuco - IAM
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P02-026A :
Medida de afinidade de proteínas por termoforese em microescala.
Pernambuco - IAM
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P02-026B :
Medida de afinidade de proteínas por termoforese em microescala. Usuário autônomo (requer treinamento).
Pernambuco - IAM
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P02-026C :
Análise de medidas de afinidade realizadas por termoforese em microescala.
Pernambuco - IAM
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P02-026D :
Treinamento de usuários em método de medição de afinidade entre biomoléculas por termoforese em microescala.
Pernambuco - IAM
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P02-027A :
Medida de estrutura secundária OU estabilidade de proteínas por espectroscopia de dicroísmo circular.
Pernambuco - IAM
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P02-027B :
Medida de estrutura secundária OU estabilidade de proteínas por espectroscopia de dicroísmo circular. Usuário autônomo (requer treinamento).
Pernambuco - IAM
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P02-027C :
Treinamento de usuários em método de medição de conteúdo de estrutura secundária OU estabilidade de proteínas por espectroscopia de dicroísmo circular.
Pernambuco - IAM
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P02-028A :
Cinética por fluorescência intrínseca.
Pernambuco - IAM
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P02-028B :
Cinética por fluorescência intrínseca. Usuário autônomo (requer treinamento).
Pernambuco - IAM
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P02-028C :
Treinamento de usuários em método de medição de cinética por fluorescência intrínseca.
Pernambuco - IAM
RPT02A - Espectrometria de Massas Rio de Janeiro - Manguinhos
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P02-002A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS) no sistema Q Exactive PLUS
Rio de Janeiro - IOC
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P02-017A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS) no sistema Q Exactive HF-X
Rio de Janeiro - IOC
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P02-001A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS) no sistema LTQ Orbitrap XL ETD
Rio de Janeiro - IOC
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P02-009A :
Análise de proteínas por eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida
Rio de Janeiro - IOC
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P02-024A :
Análise de proteínas por eletroforese unidimensional em gel de poliacrilamida
Rio de Janeiro - IOC
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P02-006A :
Cromatógrafo - ÄKTA Purifier 10A e 10B
Rio de Janeiro - IOC
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P02-018A :
Cromatógrafo - Ettan LC
Rio de Janeiro - IOC
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P02-010A :
Concentração de amostras a vácuo (sistemas SpeedVac SC 110A / SC 210A)
Rio de Janeiro - IOC
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P02-015A :
Digestão enzimática de proteínas em gel
Rio de Janeiro - IOC
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P02-022A :
Digestão enzimática de proteínas em solução
Rio de Janeiro - IOC
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P02-023A :
Dessalinização de amostras por microcolunas de fase reversa (POROS R2)
Rio de Janeiro - IOC
RPT02H - Espectrometria de Massas Paraná - Curitiba
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P02-005B :
Preparo de amostra - Rotina
Paraná - ICC
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P02-031A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS)
Paraná - ICC
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P02-032A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS)
Paraná - ICC
RPT02J - Plataforma de Produção e Caracterização de Proteínas Recombinantes Minas Gerais - Belo Horizonte
Nenhum serviço ativo para esta plataforma.