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Proteômica
A proteômica estuda a distribuição, a abundância, as modificações, as interações e as funções de uma ou de um grupo de proteínas, ou do conjunto de proteínas em uma célula ou organismo.Para a maioria das técnicas proteômicas aplicadas, é necessária a digestão das proteínas e análise de seus peptídeos, tendo sua identificação realizada através do uso de espectrometria de massas onde a medição precisa da massa e da carga, seguida de comparação computacional dos resultados com bancos de dados, muitas vezes permite identificar de qual proteína foram derivados.
Para amostras biológicas complexas com misturas de muitas proteínas, é necessária a combinação de dois ou mais métodos ortogonais de separação para aumentar a capacidade de separação dos fragmentos e, com isso, um maior poder de resolução, como LC-MS/MS. Nos últimos anos, vários métodos cromatográficos multidimensionais podem ser utilizados em estudos proteômicos shotgun, como cromatografia hidrofóbica ou troca iônica e gel filtração de alta resolução
A Plataforma Proteômica disponibiliza os seguintes serviços:
- Purificação e preparo de amostra;
- Focalização isoelétrica
- Eletroforese e análise 2D de proteínas;
- Excisão de spots/bandas de gel
- Digestão de proteínas
- Concentração e secagem de amostras;
- Análise por espectrometria de massas para identificação.
Espectrometria de Massas
A espectrometria de massas é uma técnica analítica valiosa para identificação, caracterização e quantificação de analitos. Nessa técnica, as moléculas em uma amostra são convertidas em íons em fase gasosa, que são separados no espectrômetro de massas de acordo com sua razão massa sobre a carga (m/z). Os íons produzidos são característicos de um determinado analito e, portanto, é possível sua identificação a partir do espectro de massa gerado.
A proteômica baseada na espectrometria de massa depende da dissociação/fragmentação de peptídeos e/ou proteínas para fornecer informações sobre suas sequências e estruturas. Diferentes tipos de espectrômetros de massa são compatíveis para determinados tipos de análise, como pode ver na descrição dos nossos espaços tecnológicos, e os espectrômetros de massas híbridos com diferentes analisadores acoplados podem ampliar a sua utilidade.
A identificação computacional de proteínas é feita com o auxílio de bancos de dados ou através da busca de similaridades entre espectros, utilizando softwares de busca que comparam a razão m/z teórica e experimental dos peptídeos analisados.
outras plataformas
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Serviços prestados
RPT02I - Caracterização de Proteínas Pernambuco - Recife
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P02-025A :
Purificação de proteínas por cromatografia.
Equipamento ou sistema: Cromatógrafo - Akta Pure 25M
Pernambuco
-
IAM
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P02-025B :
Purificação de proteínas por cromatografia. Usuário autônomo (requer treinamento).
Equipamento ou sistema: Cromatógrafo - Akta Pure 25M
Pernambuco
-
IAM
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P02-025C :
Treinamento de usuários em métodos de purificação de proteínas (cromatografia).
Equipamento ou sistema: Cromatógrafo - Akta Pure 25M
Pernambuco
-
IAM
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P02-025D :
Consultoria para planejamento processo de produção de proteínas recombinantes de interesse científico e biotecnológico
Equipamento ou sistema: Cromatógrafo - Akta Pure 25M
Pernambuco
-
IAM
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P02-026A :
Medida de afinidade de proteínas por termoforese em microescala.
Equipamento ou sistema: Sistema de Termoforese em Microescala - Monolith NT.115
Pernambuco
-
IAM
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P02-026B :
Medida de afinidade de proteínas por termoforese em microescala. Usuário autônomo (requer treinamento).
Equipamento ou sistema: Sistema de Termoforese em Microescala - Monolith NT.115
Pernambuco
-
IAM
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P02-026C :
Análise de medidas de afinidade realizadas por termoforese em microescala.
Equipamento ou sistema: Sistema de Termoforese em Microescala - Monolith NT.115
Pernambuco
-
IAM
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P02-026D :
Treinamento de usuários em método de medição de afinidade entre biomoléculas por termoforese em microescala.
Equipamento ou sistema: Sistema de Termoforese em Microescala - Monolith NT.115
Pernambuco
-
IAM
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P02-027A :
Medida de estrutura secundária OU estabilidade de proteínas por espectroscopia de dicroísmo circular.
Equipamento ou sistema: Espectropolarímetro - Jasco J-1100
Pernambuco
-
IAM
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P02-027B :
Medida de estrutura secundária OU estabilidade de proteínas por espectroscopia de dicroísmo circular. Usuário autônomo (requer treinamento).
Equipamento ou sistema: Espectropolarímetro - Jasco J-1100
Pernambuco
-
IAM
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P02-027C :
Treinamento de usuários em método de medição de conteúdo de estrutura secundária OU estabilidade de proteínas por espectroscopia de dicroísmo circular.
Equipamento ou sistema: Espectropolarímetro - Jasco J-1100
Pernambuco
-
IAM
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P02-028A :
Cinética por fluorescência intrínseca.
Equipamento ou sistema: Nanodrop OneC
Pernambuco
-
IAM
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P02-028B :
Cinética por fluorescência intrínseca. Usuário autônomo (requer treinamento).
Equipamento ou sistema: Nanodrop OneC
Pernambuco
-
IAM
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P02-028C :
Treinamento de usuários em método de medição de cinética por fluorescência intrínseca.
Equipamento ou sistema: Nanodrop OneC
Pernambuco
-
IAM
RPT02A - Espectrometria de Massas Rio de Janeiro - Manguinhos
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P02-002A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS) no sistema Q Exactive PLUS
Equipamento ou sistema: Espectrometria de Massas – Proteômica
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-017A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS) no sistema Q Exactive HF-X
Equipamento ou sistema: Espectrometria de Massas – Proteômica
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-001A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS) no sistema LTQ Orbitrap XL ETD
Equipamento ou sistema: Espectrometria de Massas – Proteômica
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-009A :
Análise de proteínas por eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida
Equipamento ou sistema: Eletroforese em gel de poliacrilamida
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-024A :
Análise de proteínas por eletroforese unidimensional em gel de poliacrilamida
Equipamento ou sistema: Eletroforese em gel de poliacrilamida
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-006A :
Cromatógrafo - ÄKTA Purifier 10A e 10B
Equipamento ou sistema: Cromatografia líquida
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-018A :
Cromatógrafo - Ettan LC
Equipamento ou sistema: Cromatografia líquida
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-010A :
Concentração de amostras a vácuo (sistemas SpeedVac SC 110A / SC 210A)
Equipamento ou sistema: Preparo de amostras – Secagem no SpeedVac
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-015A :
Digestão enzimática de proteínas em gel
Equipamento ou sistema: Preparo de amostras – Digestão enzimática e dessalinização
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-022A :
Digestão enzimática de proteínas em solução
Equipamento ou sistema: Preparo de amostras – Digestão enzimática e dessalinização
Rio de Janeiro
-
IOC
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P02-023A :
Dessalinização de amostras por microcolunas de fase reversa (POROS R2)
Equipamento ou sistema: Preparo de amostras – Digestão enzimática e dessalinização
Rio de Janeiro
-
IOC
RPT02H - Espectrometria de Massas Paraná - Curitiba
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P02-005B :
Preparo de amostra - Rotina
Equipamento ou sistema: Espectrometria de Massas - Preparo de amostras
Paraná
-
ICC
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P02-031A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS)
Equipamento ou sistema: Espectrometria de Massas - Proteômica
Paraná
-
ICC
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P02-032A :
Análise por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS/MS)
Equipamento ou sistema: Espectrometria de Massas - Moléculas diversas
Paraná
-
ICC
RPT02J - Plataforma de Produção e Caracterização de Proteínas Recombinantes Minas Gerais - Belo Horizonte
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